东山县中医院作为一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的综合性中医院，其组织结构设计旨在充分发挥中医药特色，同时结合现代医院管理理念。以下是其组织架构的主要组成部分：

一、党政管理机构

1. 党委系统

   • 党委办公室、纪委、组织部、宣传部等，负责医院党建和思想政治工作。

2. 行政系统

   • 院长/副院长：全面负责医院管理工作。

   • 院办公室：综合协调全院行政事务。

   • 医务科：医疗质量与安全管理。

   • 护理部：护理工作管理与质量控制。

   • 人事科：人力资源规划与管理。

   • 财务科：财务管理与预算控制。

   • 科教科：科研教学与继续教育。

二、临床与医技科室

1. 中医科室

   • 内科、外科、妇科、儿科、针灸推拿科、康复科等。

2. 西医科室

   • 急诊科、麻醉科、医学影像科等。

3. 医技科室

   • 检验科、药剂科、功能检查科等。

三、特色科室与中心

• 治未病中心：开展中医体质辨识与健康干预。

• 康复中心：提供中西医结合康复服务。

• 中药制剂室：研发与生产医院内部使用的中药制剂。

四、支撑保障部门

• 信息科：医院信息系统建设与维护。

• 总务科：后勤保障与设备管理。

• 保卫科：医院安全与消防管理。