新密市中医院作为一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的综合性中医院，其组织结构体现了中医特色与现代医院管理的结合。以下是其组织架构的主要组成部分：
一、党政管理机构
党委系统
党委办公室、纪委、组织部、宣传部等，负责医院的党建和思想政治工作。
行政系统
院长/副院长：全面负责医院的运营和管理。
院办公室：协调各部门工作。
医务科：医疗质量与安全管理。
护理部：护理工作的规划与管理。
人事科：人力资源管理。
财务科：财务管理和经济核算。
科教部：科研与教学管理。
二、临床与医技科室
中医科室
内科、外科、妇科、儿科、针灸推拿科等。
西医科室
急诊科、ICU、外科、内科等。
医技科室
检验科、放射科、B超室、心电图室等。
三、特色科室
中医特色治疗中心：提供针灸、推拿、拔罐等传统中医治疗。
康复医学科：针对中风后遗症、骨伤后康复等提供专业康复治疗。
治未病中心：开展健康体检、亚健康调理等预防保健服务。
四、支撑保障部门
后勤保障部：负责医院后勤服务与设备维护。
信息科：医院信息化建设与管理。
保卫科：医院安全与消防管理。
